RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	IL4R	P24394	825 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HTR1B	P28222	390 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SERPINB6	P35237	376 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	BLK	P51451	505 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH6	P55285	790 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AP1S1	P61966	158 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SEMG2	Q02383	582 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PPARD	Q03181	441 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf61	Q13536	156 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM14	Q14142	442 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF235	Q14590	738 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	INPP5A	Q14642	412 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AGER	Q15109	404 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF4	Q15306	451 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MARC1	Q5VT66	337 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD6	Q8NC69	237 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RFFL	Q8WZ73	363 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	APOO	Q9BUR5	198 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCG4	Q9H172	646 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPY26P	Q9H489	355 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DEF6	Q9H4E7	631 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AK5	Q9Y6K8	562 aa		9.46	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNA1B	Q00975	2339 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP13	Q12802	2813 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MX80	341 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	YY2	O15391	372 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GCAT	O75600	419 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PROSC	O94903	275 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX11B	O96011	259 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-CO3	P00414	261 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GP1BA	P07359	652 aa		9.45	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	TPM1	P09493	284 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSE	P14091	401 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MMP12	P39900	470 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MMRN1	Q13201	1228 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PDK2	Q15119	407 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC18A3	Q16572	532 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LIPI	Q6XZB0	460 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MACC1	Q6ZN28	852 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RBFA	Q8N0V3	343 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ATL2	Q8NHH9	583 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM71B	Q8TC56	605 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GLMN	Q92990	594 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NXPE2	Q96DL1	559 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TBATA	Q96M53	351 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC7	Q99615	494 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NENF	Q9UMX5	172 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RAX	Q9Y2V3	346 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1A2	Q9Y585	309 aa		9.45	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SPEG	Q15772	3267 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CPED1	A4D0V7	1026 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LMO7DN	F2Z398	122 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AKR1B10	O60218	316 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	OPA1	O60313	960 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SOCS5	O75159	536 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RASGRP1	O95267	797 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TNF	P01375	233 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PCCB	P05166	539 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT7	P08729	469 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CD48	P09326	243 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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