RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559192.5

USP3-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3, Length 5,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-210ENST00000559192 WNT8BQ93098 351 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TWNKQ96RR1 684 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM50BQ9Y247 325 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PSAT1Q9Y617 370 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SNAP91O60641 907 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CABYRO75952 493 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CYP4B1P13584 511 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ITGB6P18564 788 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MAGP20916 626 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 WNT7BP56706 349 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TNK2Q07912 1038 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 EPGNQ6UW88 154 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM83AQ86UY5 434 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PIGZQ86VD9 579 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FBXL18Q96ME1 805 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 HPS4Q9NQG7 708 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 WWOXQ9NZC7 414 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 BTN3A1O00481 513 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 IRF1P10914 325 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 LBPP18428 481 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 STT3AP46977 705 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TUBA4AP68366 448 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RAB6CQ53S08 254 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.15□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 H3BNX3 289 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 FBXO21O94952 628 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 TWF1Q12792 350 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 COX10Q12887 443 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 SPESP1Q6UW49 350 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ABI1Q8IZP0 508 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 TLE6Q9H808 572 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 DTLQ9NZJ0 730 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 SQORQ9Y6N5 450 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CENPXA8MT69 81 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 TOR1BO14657 336 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 MLNP12872 115 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ADORA2AP29274 412 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 TTKP33981 857 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 NOS2P35228 1153 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CD86P42081 329 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 PGGT1BP53609 377 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ATP12AP54707 1039 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CXCL9Q07325 125 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 BNIP3Q12983 259 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 MIB1Q86YT6 1006 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 CNTD1Q8N815 330 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 APOL4Q9BPW4 351 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 HGH1Q9BTY7 390 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 ADI1Q9BV57 179 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 MRIQ9BWK5 157 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-210ENST00000559192 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms