RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM131	Q92545	1883 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	C4orf47	A7E2U8	309 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PYGM	P11217	842 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	MMP12	P39900	470 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DSC2	Q02487	901 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZBTB17	Q13105	803 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	XRCC4	Q13426	336 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	HAUS1	Q96CS2	278 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292		A0A1W2PR77	199 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	IGLON5	A6NGN9	336 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	OPHN1	O60890	802 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TM7SF2	O76062	418 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ID4	P47928	161 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TRAF2	Q12933	501 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	NOMO1	Q15155	1222 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM58	Q8NG06	486 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17	3e-8	■■■■□ 20
PCNX1-206	ENST00000554292	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PGLS	O95336	258 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM193A	P78312	1265 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	GSE1	Q14687	1217 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF19	Q2TAC6	998 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	LAYN	Q6UX15	382 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	RMDN1	Q96DB5	314 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	MYOC	Q99972	504 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	CFAP69	A5D8W1	941 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DFNA5	O60443	496 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	MMP20	O60882	483 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	CTSK	P43235	329 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	BNC1	Q01954	994 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TEX44	Q53QW1	395 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DPPA4	Q7L190	304 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TTC13	Q8NBP0	860 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	VAT1	Q99536	393 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	GAREM1	Q9H706	876 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	GDF3	Q9NR23	364 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	LAMA1	P25391	3075 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292		H7C0C1	242 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	TLR4	O00206	839 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	WNT9A	O14904	365 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	WNT1	P04628	370 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ITIH2	P19823	946 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP5O	P48047	213 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	FGL2	Q14314	439 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	HLA-B	Q31612	363 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	USP45	Q70EL2	814 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	CNTD1	Q8N815	330 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	ACTL9	Q8TC94	416 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	AGAP3	Q96P47	875 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292	FZD3	Q9NPG1	666 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PCNX1-206	ENST00000554292		A6NNZ2	444 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	FPGT	O14772	594 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	ELFN1	P0C7U0	828 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF883	P0CG24	379 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	PTPN3	P26045	913 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PCNX1-206	ENST00000554292	EPHB1	P54762	984 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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