RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SEPT3	Q9UH03	358 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PLD2	O14939	933 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PPFIA2	O75334	1257 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KRT38	O76015	456 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PROSC	O94903	275 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ITGB2	P05107	769 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TACR2	P21452	398 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MIP	P30301	263 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP25	P42331	645 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	AIF1	P55008	147 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ARTN	Q5T4W7	220 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FBXL22	Q6P050	247 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KIAA1328	Q86T90	577 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PEBP4	Q96S96	227 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SEMA3C	Q99985	751 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FZD10	Q9ULW2	581 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NBAS	A2RRP1	2371 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		F5H5T6	163 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF10	O60809	474 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RNF224	P0DH78	156 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MAN1A1	P33908	653 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GGCX	P38435	758 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MESD	Q14696	234 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NR0B2	Q15466	257 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	C5orf22	Q49AR2	442 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		K7ERQ8	282 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PCDH8	O95206	1070 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MT-CO1	P00395	513 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TCF4	P15884	667 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	IL1R2	P27930	398 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CCL7	P80098	99 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SPIDR	Q14159	915 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQM1	296 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SLC7A4	O43246	635 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	AQP9	O43315	295 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CSF2	P04141	144 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	JUND	P17535	347 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	AKT2	P31751	481 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SLC1A1	P43005	524 aa		13.98	□□□□□ -0.17

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