RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 DPP6P42658 865 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ATP5OP48047 213 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SKOR1P84550 965 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 WASHC5Q12768 1159 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RALGDSQ12967 914 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CCDC181Q5TID7 509 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PAF1Q8N7H5 531 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CEP76Q8TAP6 659 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RAB7BQ96AH8 199 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 AGAP3Q96P47 875 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PR77 199 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 C4orf47A7E2U8 309 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ARHGAP33O14559 1287 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KCNK3O14649 394 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ENC1O14682 589 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TSPAN6O43657 245 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 FZD6O60353 706 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TJP3O95049 919 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PGLSO95336 258 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ALPIP09923 528 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RBP3P10745 1247 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 C6P13671 934 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CTPS1P17812 591 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NFKB1P19838 968 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CD38P28907 300 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CETN2P41208 172 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GRIA4P48058 902 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CLDN2P57739 230 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 FAM193AP78312 1265 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 LMNB2Q03252 620 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RPS6KA1Q15418 735 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TEX44Q53QW1 395 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NEK5Q6P3R8 708 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ZNF567Q8N184 647 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TRIM58Q8NG06 486 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 FEM1CQ96JP0 617 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TLR10Q9BXR5 811 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IL21RQ9HBE5 538 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 UBP1Q9NZI7 540 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 AMACRQ9UHK6 382 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CHKBQ9Y259 395 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 POM121BA6NF01 834 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HACD1B0YJ81 288 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TM7SF2O76062 418 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PRLP01236 227 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GM2AP17900 193 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 LHCGRP22888 699 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms