RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PDF	Q9HBH1	243 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	EMCN	Q9ULC0	261 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CARNS1	A5YM72	827 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TEX28	O15482	410 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TIMM44	O43615	452 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINA6	P08185	405 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ARNT	P27540	789 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CPOX	P36551	454 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINB8	P50452	374 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	EPHB3	P54753	998 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GNA12	Q03113	381 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CNGA3	Q16281	694 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	WBP2	Q969T9	261 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TADA1	Q96BN2	335 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TREX1	Q9NSU2	369 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	BIRC5	O15392	142 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PPM1A	P35813	382 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SGSH	P51688	502 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SEPT6	Q14141	434 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CFAP157	Q5JU67	520 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ADGRF1	Q5T601	910 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	LPCAT4	Q643R3	524 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	OR7D4	Q8NG98	312 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	VPS39	Q96JC1	886 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MUSK	O15146	869 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN11	O75508	207 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GJB3	O75712	270 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	BAIAP3	O94812	1187 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GSR	P00390	522 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA31D3	P0C874	917 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF235	Q14590	738 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	INSC	Q1MX18	579 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MFN1	Q8IWA4	741 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF599	Q96NL3	588 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA3C	Q99985	751 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	THAP1	Q9NVV9	213 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GVG6	124 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PLIN3	O60664	434 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	LILRB3	O75022	631 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	HEATR9	A2RTY3	570 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TSPAN3	O60637	253 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ZMPSTE24	O75844	475 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT34	O76011	436 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	FGF18	O76093	207 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	AHSG	P02765	367 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PAM	P19021	973 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DLG2	Q15700	870 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SPON2	Q9BUD6	331 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PNPO	Q9NVS9	261 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	BPTF	Q12830	3046 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PROC	P04070	461 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PRKCG	P05129	697 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GABRB3	P28472	473 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CA8	P35219	290 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CTBP1	Q13363	440 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TUBB3	Q13509	450 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GRM3	Q14832	879 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A12	Q96S37	553 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR22	Q99680	433 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		15.79	■□□□□ 0.12

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