RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089		A0A087X1B8	175 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	AP3D1	O14617	1153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	GFPT2	O94808	682 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SGPL1	O95470	568 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CD63	P08962	238 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	GJC1	P36383	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	INHBE	P58166	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PRKG2	Q13237	762 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PDILT	Q8N807	584 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RITA1	Q96K30	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PSMD14	O00487	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RRH	O14718	337 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ECE2	O60344	883 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	HOXB7	P09629	217 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	MYL6B	P14649	208 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	NFKBIA	P25963	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	KLRC2	P26717	231 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	POU1F1	P28069	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CIITA	P33076	1130 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ABCD1	P33897	745 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN9	P43378	593 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	MTNR1A	P48039	350 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TOMM20	Q15388	145 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
MDM2-223	ENST00000536089	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM2-223	ENST00000536089	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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