RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPH1	Q92598	858 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT35	Q92764	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GAD1	Q99259	594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PQF6	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00473	A8K010	186 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CES2	O00748	559 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HS6ST1	O60243	411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TPPP	O94811	219 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MATN1	P21941	496 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP3A7	P24462	503 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC8A1	P32418	973 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN9	P43378	593 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCR10	P46092	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DIO1	P49895	249 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMP	P49913	170 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GNAQ	P50148	359 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EFNA5	P52803	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PMS2	P54278	862 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE1A	P54750	535 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SCN1B	Q07699	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PTK6	Q13882	451 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNB1	Q14721	858 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TNIP1	Q15025	636 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MCU	Q8NE86	351 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NPAS1	Q99742	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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