RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 D6RAR5 112 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PIK3R2O00459 728 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 BUB1O43683 1085 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 GCATO75600 419 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RGS7P49802 495 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 OXCT1P55809 520 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 KCNAB2Q13303 367 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 FGL2Q14314 439 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ALS2CLQ60I27 953 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ALG14Q96F25 216 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 DYRK4Q9NR20 520 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SPASTQ9UBP0 616 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.04■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ITPR2Q14571 2701 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 LMO7DNF2Z398 122 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 O00370 1275 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RAD51BO15315 384 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SPINT1O43278 529 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PRAMEF10O60809 474 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 FYNP06241 537 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CD19P15391 556 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CCKBRP32239 447 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CHRNA3P32297 505 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CCR10P46092 362 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 KRT39Q6A163 491 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PMF1Q6P1K2 205 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 BORAQ6PGQ7 559 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 DTX1Q86Y01 620 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RBFAQ8N0V3 343 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 MREGQ8N565 214 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TMIEQ8NEW7 156 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RNF34Q969K3 372 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 HDAC8Q9BY41 377 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.03■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ANKRD62A6NC57 917 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 F5H5T6 163 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 H3BQF6 201 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RNF103O00237 685 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 APOEP02649 317 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ANXA6P08133 673 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 VDRP11473 427 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ITIH1P19827 911 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 MXI1P50539 228 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 POLE2P56282 527 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 C1orf61Q13536 156 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 CUL1Q13616 776 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TMEM74Q96NL1 305 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 ZMYND15Q9H091 742 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RAB20Q9NX57 234 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.02■□□□□ 0.16
MEG3-218ENST00000521812 A0A1W2PQM1 296 aa16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 FBXO21O94952 628 aa16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 FTCDO95954 541 aa16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 CCL7P80098 99 aa16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 CBWD6Q4V339 395 aa16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MEG3-218ENST00000521812 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms