RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA13P48723 471 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMIM20-202ENST00000514384 POU5F1BQ06416 359 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMIM20-202ENST00000514384 FAM187BQ17R55 369 aa7.29□□□□□ -1.24
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SMIM20-202ENST00000514384 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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SMIM20-202ENST00000514384 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF534Q76KX8 674 aa7.29□□□□□ -1.24
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