RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDIT4Q9NX09 232 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL37Q9NZH6 218 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAK5Q9P286 719 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 YIPF1Q9Y548 306 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.68□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP290O15078 2479 aa5.68□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 COL4A6Q14031 1691 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PPC1 479 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF197O14709 1029 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOL1O14791 398 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PER2O15055 1255 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCL16O15467 120 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TLR5O60602 858 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT4P19013 534 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HDCP19113 662 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5OP48047 213 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRIP1P48552 1158 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RASSF2P50749 326 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLCN4P51793 760 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBX4P57082 545 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 EFEMP1Q12805 493 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ11Q14654 390 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 C4orf22Q6V702 233 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHSY1Q86X52 802 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF276Q8N554 614 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BANPQ8N9N5 519 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LEMD2Q8NC56 503 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGAP11Q8TF27 550 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf82Q8WW14 230 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CASP10Q92851 521 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NT5C3BQ969T7 300 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAF2Q96CS3 445 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERP27Q96DN0 273 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTP4Q96DX8 246 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF157Q96PX1 679 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PEBP4Q96S96 227 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPY6RQ99463 290 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.67□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXQ1Q9C009 403 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS11Q9H270 941 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 EBF2Q9HAK2 575 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.67□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.67□□□□□ -1.5
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