RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1B0GVM2	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM63A	O94886	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ETFA	P13804	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGAX	P20702	1163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	AMT	P48728	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GNAQ	P50148	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	DSC1	Q08554	894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT32	Q14532	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	EVPL	Q92817	2033 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TIMM23	O14925	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SEC14L5	O43304	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NDUFB4	O95168	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	VNN2	O95498	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	AGA	P20933	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CHAT	P28329	748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MAN1A1	P33908	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGA	P37287	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FHL1	Q13642	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284		J3KR12	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SNAP23	O00161	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SEC14L2	O76054	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GLUD1	P00367	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP2	P08253	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXB5	P09067	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ICAM3	P32942	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SHMT1	P34896	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	RXRG	P48443	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GLUD2	P49448	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MXI1	P50539	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HYI	Q5T013	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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