RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615		J3KR12	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	TACC1	O75410	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	RGS11	O94810	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	VNN2	O95498	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	HEXA	P06865	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	FCGR1A	P12314	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CXCR3	P49682	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	MXI1	P50539	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PEX5	P50542	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	HSPB2	Q16082	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	IL25	Q9H293	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ACOT8	O14734	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CH25H	O95992	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCD1	P33897	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GVC2	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615		A6NLC8	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	AGR2	O95994	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	ART1	P52961	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CLDN2	P57739	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-231	ENST00000495615	WNT9B	O14905	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE7	O76087	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	F9	P00740	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	TF	P02787	698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	HOXB5	P09067	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	ETFA	P13804	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	DAO	P14920	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	EDN2	P20800	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCD3	P28288	659 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	KRT9	P35527	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE1	Q13065	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE4	Q13068	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	GSTA3	Q16772	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBWD5-231	ENST00000495615	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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