RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 hDV102S1A0JD36 115 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CLGNO14967 610 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 LINC01565O15544 149 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZIC3O60481 467 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GUCY1B2O75343 617 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PMS2P2O95744 297 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CD58P19256 250 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ITGAXP20702 1163 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CNTFP26441 200 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CLDN2P57739 230 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 UBE3AQ05086 875 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CHRNDQ07001 517 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF329Q86UD4 541 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 POC1AQ8NBT0 407 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ERGIC1Q969X5 290 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GCC1Q96CN9 775 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HES6Q96HZ4 224 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PEMTQ9UBM1 199 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.25□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TEX22C9J3V5 150 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TULP2O00295 520 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KLK8O60259 260 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CLDN14O95500 239 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 POLBP06746 335 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ITGADQ13349 1161 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TDGQ13569 410 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NEDD9Q14511 834 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EFNB3Q15768 340 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 AMZ1Q400G9 498 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 USP43Q70EL4 1123 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GPAT4Q86UL3 456 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ELP4Q96EB1 424 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SCLT1Q96NL6 688 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TMEM160Q9NX00 188 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 RRN3Q9NYV6 651 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MDFICQ9P1T7 246 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KIAA1456Q9P272 454 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HSF4Q9ULV5 492 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.24□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 A0A0B4J293 547 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PRAC2D3DTV9 90 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 BMPR1BO00238 502 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TIPRLO75663 272 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KDM4BO94953 1096 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 IGLV2-11P01706 119 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HEXAP06865 529 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 UMODP07911 640 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HSD3B1P14060 373 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 STX2P32856 288 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PGM1P36871 562 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TNFAIP1Q13829 316 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TAF11Q15544 211 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NFIL3Q16649 462 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF766Q5HY98 468 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TUBA1AQ71U36 451 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms