RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZVU0 165 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PPM1EQ8WY54 764 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CDKL2Q92772 493 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CERS2Q96G23 380 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 KCNK12Q9HB15 430 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TLDC2A0PJX2 215 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MROH6A6NGR9 719 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TTC34A8MYJ7 566 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LDB2O43679 373 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PIGNO95427 931 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CRTAMO95727 393 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 NMBRP28336 390 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 GCAP28676 217 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 ATP5DP30049 168 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MSH2P43246 934 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TNFRSF4P43489 277 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 EPHB1P54762 984 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PDE1BQ01064 536 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MGAT5Q09328 741 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 QPCTQ16769 361 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CES3Q6UWW8 571 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LRRC6Q86X45 466 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 KRT222Q8N1A0 295 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PIH1D2Q8WWB5 315 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MFSD3Q96ES6 412 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 MSANTD3Q96H12 275 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PAFAH2Q99487 392 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TMEM245Q9H330 911 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 CENPHQ9H3R5 247 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TRABDQ9H4I3 376 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TREX1Q9NSU2 369 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 EURLQ9NYK6 297 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 13.1
PKP4-215ENST00000494945 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.09□□□□□ -0.63
PKP4-215ENST00000494945 A0A0J9YYE9 177 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 SMIM23A6NLE4 172 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 H3BQF6 201 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 BNIP3LO60238 219 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 TRBC1P01850 177 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 GLULP15104 373 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 PSMA3P25788 255 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 CTHP32929 405 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 SLCO1A2P46721 670 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 SOX9P48436 509 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 GALK1P51570 392 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 PFKPQ01813 784 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 ACVR1Q04771 509 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 ZNF234Q14588 700 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.08□□□□□ -0.64
PKP4-215ENST00000494945 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms