RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492779.5

RBM39-237, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-237ENST00000492779 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 GBP5Q96PP8 586 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.343e-7■□□□□ 9.7
RBM39-237ENST00000492779 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 SNX25Q9H3E2 840 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 H3BSA7 217 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 BIRC5O15392 142 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 OPHN1O60890 802 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 RFPL2O75678 378 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 KRT38O76015 456 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CXCL14O95715 111 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CRTAMO95727 393 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 SOD2P04179 222 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ODC1P11926 461 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CPB1P15086 417 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 HSD3B2P26439 372 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 NMBRP28336 390 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PMLP29590 882 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PNPLA4P41247 253 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ZBTB17Q13105 803 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ADGRE1Q14246 886 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ACAP1Q15027 740 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PSMD5Q16401 504 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ATG16L1Q676U5 607 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CLEC14AQ86T13 490 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 LCA5Q86VQ0 697 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CEP97Q8IW35 865 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 MYLPFQ96A32 169 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 TIFAQ96CG3 184 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 RCN3Q96D15 328 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CATSPER2Q96P56 530 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 CDRT15Q96T59 188 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 NPAS2Q99743 824 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 SLC29A1Q99808 456 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 KLC2Q9H0B6 622 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-237ENST00000492779 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 IGFLR1Q9H665 355 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-237ENST00000492779 CPA3P15088 417 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 LAG3P18627 525 aa6.65□□□□□ -1.35
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RBM39-237ENST00000492779 SAT1P21673 171 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 TGM2P21980 687 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 PIK3R1P27986 724 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 SDC4P31431 198 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 SERPINB6P35237 376 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 FDFT1P37268 417 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 MAGEA12P43365 314 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 ALDH1A3P47895 512 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 CXCR3P49682 368 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-237ENST00000492779 CSRP3P50461 194 aa6.65□□□□□ -1.35
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