RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 CBY3A6NI87 242 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SOCS6O14544 535 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SETSIPP0DME0 302 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CETPP11597 493 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 MCM2P49736 904 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SLC20A2Q08357 652 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CUL4BQ13620 913 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SNAPC3Q92966 411 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ERGIC1Q969X5 290 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CRB3Q9BUF7 120 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CHODLQ9H9P2 273 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 C1RLQ9NZP8 487 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 PSAT1Q9Y617 370 aa3.71□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM72CH0Y354 149 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ATP2C2O75185 946 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TIPRLO75663 272 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF883P0CG24 379 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HLA-DOBP13765 273 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TNNT1P13805 278 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HTR3AP46098 478 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 UBE4AQ14139 1066 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ESCO2Q56NI9 601 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM72AQ5TYM5 149 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM72DQ6L9T8 149 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM72BQ86X60 149 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0U1RQF3 1178 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PS18 150 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 RFPL2O75678 378 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM155BO75949 473 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CD53P19397 219 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HDAC4P56524 1084 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 MORC3Q14149 939 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CSTL1Q9H114 145 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ASPDHA6ND91 283 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HSPB2A8KAH6 182 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 KLRF2D3W0D1 207 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 STX16O14662 325 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CDH1P12830 882 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 KRT72Q14CN4 511 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 HSPB2Q16082 182 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TIGD6Q17RP2 521 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CES5AQ6NT32 575 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 WDR73Q6P4I2 378 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 ALG14Q96F25 216 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TAF1P21675 1872 aa3.68□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 SERINC4A6NH21 518 aa3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 KLK8O60259 260 aa3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 NDUFB4O95168 129 aa3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 CHRM4P08173 479 aa3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SKAP2-206ENST00000489977 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms