RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SYT13Q7L8C5 426 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 OR2T3Q8NH03 318 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NETO1Q8TDF5 533 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ART4Q93070 314 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LRRC39Q96DD0 335 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PPM1HQ9ULR3 514 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SNX24Q9Y343 169 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN11A1L157 253 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MAGEB16A2A368 324 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FZD6O60353 706 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TDGF1P13385 188 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HOXB2P14652 356 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GRIA4P48058 902 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NPY2RP49146 381 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DGKEP52429 567 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ITGA8P53708 1063 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TERF1P54274 439 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SEC13P55735 322 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CFAP58Q5T655 872 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CCNJLQ8IV13 435 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PDIK1LQ8N165 341 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RAB7BQ96AH8 199 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EXOC2Q96KP1 924 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRIB3Q96RU7 358 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FAM129BQ96TA1 746 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DPH5Q9H2P9 285 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CHRDQ9H2X0 955 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRABDQ9H4I3 376 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DYRK4Q9NR20 520 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HACD3Q9P035 362 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GDF9O60383 454 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PMPCBO75439 489 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ALDH1A2O94788 518 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PGLSO95336 258 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RETP07949 1114 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HLA-EP13747 358 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C5AR1P21730 350 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ITGB7P26010 798 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NUMBP49757 651 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ARL4CP56559 192 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PDE1BQ01064 536 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SATB1Q01826 763 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SLC1A5Q15758 541 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ARSIQ5FYB1 569 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms