RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LAMA5O15230 3695 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MEI4A8MW99 385 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GFRA2O00451 464 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FBXO21O94952 628 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IFNB1P01574 187 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IGLV3-27P01718 113 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ACADMP11310 421 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TCF4P15884 667 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IL1R2P27930 398 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NR2C2P49116 596 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC11A2P49281 568 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 VPS41P49754 854 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TPMTP51580 245 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CDH6P55285 790 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LMAN2Q12907 356 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 KRT81Q14533 505 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ITIH4Q14624 930 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NOMO1Q15155 1222 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LLGL1Q15334 1064 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HIF1AQ16665 826 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 KYNUQ16719 465 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LONRF1Q17RB8 773 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FSCBQ5H9T9 825 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MFN1Q8IWA4 741 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DEFB106AQ8N104 65 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PDIK1LQ8N165 341 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SCML4Q8N228 414 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SNX19Q92543 992 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PAK5Q9P286 719 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SMIM23A6NLE4 172 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 E7ESA3 106 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 APOL1O14791 398 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ZNF217O75362 1048 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RBP3P10745 1247 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TACR2P21452 398 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CD6P30203 668 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CSKP41240 450 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLCO1A2P46721 670 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 XRCC4Q13426 336 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DCAF6Q58WW2 860 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 STRADAQ7RTN6 431 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CHSY1Q86X52 802 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 APCDD1Q8J025 514 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EMC1Q8N766 993 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HSPH1Q92598 858 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RNF34Q969K3 372 aa6.35□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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