RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SNAP23O00161 211 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LDLRAD4O15165 306 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 HSPA12AO43301 675 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TGFB3P10600 412 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ETFAP13804 333 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KIF5AQ12840 1032 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KLHL22Q53GT1 634 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PGBD5Q8N414 524 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 WASF1Q92558 559 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 IL25Q9H293 177 aa6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 hDV102S1A0JD36 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 A6NLC8 198 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R3DO95685 299 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SSTR2P30874 369 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ART1P52961 327 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MMEL1Q495T6 779 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 XKR9Q5GH70 373 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TXNDC8Q6A555 127 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LRFN5Q96NI6 719 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SARDHQ9UL12 918 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.94□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CKAP5Q14008 2032 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZIC3O60481 467 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MTA2O94776 668 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MYBPHQ13203 477 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KLHL29Q96CT2 875 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 KCND2Q9NZV8 630 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 A0A0U1RQJ8 604 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NDUFB4O95168 129 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 F9P00740 461 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TFP02787 698 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 AGAP20933 346 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 EFNB3Q15768 340 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SGO1Q5FBB7 561 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FBXL8Q96CD0 374 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 RTP4Q96DX8 246 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 WWOXQ9NZC7 414 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MPP6Q9NZW5 540 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.92□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ACOT8O14734 319 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CREB3O43889 395 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ATP1A3P13637 1013 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TUBA1BP68363 451 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PTP4A2Q12974 167 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LCTLQ6UWM7 567 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TBATAQ96M53 351 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZNF570Q96NI8 536 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CSF3RQ99062 836 aa6.91□□□□□ -1.3
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