RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, human

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP1-206	ENST00000469947	RAB10	P61026	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PPIL2	Q13356	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ACD	Q96AP0	544 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	GPR20	Q99678	358 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ASB7	Q9H672	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SNAP29	O95721	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	NCK1	P16333	377 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SGCD	Q92629	289 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	JCHAIN	P01591	159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ELK4	P28324	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MATK	P42679	507 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	OAZ1	P54368	228 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	DCLK1	O15075	740 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	EXT2	Q93063	718 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	GBA3	Q9H227	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CLDN5	O00501	218 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	INPP4B	O15327	924 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SNAP91	O60641	907 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC1A2	P43004	574 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	APLP1	P51693	650 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	PIF1	Q9H611	641 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP1-206	ENST00000469947	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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