RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TEKT5Q96M29 485 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC114Q96M63 670 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA3CQ99985 751 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IER2Q9BTL4 223 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NOD2Q9HC29 1040 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GLOD4Q9HC38 313 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF14Q9UBS8 474 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC23Q9UJX2 597 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SARDHQ9UL12 918 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP69A5D8W1 941 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf60A6NFR6 353 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR33A8MZF0 331 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ALOX15BO15296 676 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MID1O15344 667 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LAMTOR5O43504 91 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PHF2O75151 1096 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 APBB3O95704 486 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNB1P01574 187 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT2B4P06133 528 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGAVP06756 1048 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP2P08253 660 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CR2P20023 1033 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC8A1P32418 973 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CD86P42081 329 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CSNK1DP48730 415 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD51Q06609 339 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C2orf54Q08AI8 447 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP1B1Q16678 543 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TMIEQ8NEW7 156 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ATL2Q8NHH9 583 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 VOPP1Q96AW1 172 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ARRDC3Q96B67 414 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA13Q96N96 652 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 VAT1Q99536 393 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CD93Q9NPY3 652 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 UBP1Q9NZI7 540 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AMACRQ9UHK6 382 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PP55 124 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GCATO75600 419 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH1A2O94788 518 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 METTL18O95568 372 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT14P02533 472 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DNTTP04053 509 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRNPP04156 253 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMB4P28070 264 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FNTBP49356 437 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TERF1P54274 439 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AP1S1P61966 158 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms