RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OXSMQ9NWU1 459 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ASB3Q9Y575 518 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD3Q9Y597 815 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IRAK3Q9Y616 596 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MOSPD3O75425 235 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 WFS1O76024 890 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 C1RP00736 705 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 FDXRP22570 491 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CD151P48509 253 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 PLD1Q13393 1074 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DRC3Q9H069 523 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NOD2Q9HC29 1040 aa5.68□□□□□ -1.5
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