RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HPS6Q86YV9 775 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RORBQ92753 470 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TPD52L3Q96J77 140 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FAM20BO75063 409 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ANXA6P08133 673 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GPR15P49685 360 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SLC5A3P53794 718 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TNK2Q07912 1038 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 EPS8Q12929 822 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 NRP2O60462 931 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RASSF9O75901 435 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 METTL18O95568 372 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LINC00032P0C843 101 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SOX6P35712 828 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KRT20P35900 424 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SEMA5AQ13591 1074 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SVOPQ8N4V2 548 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SPG21Q9NZD8 308 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 STK39Q9UEW8 545 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PADI3Q9ULW8 664 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 FFAR3O14843 346 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GPR42O15529 346 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 NR1H2P55055 460 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 AADATQ8N5Z0 425 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LMO3Q8TAP4 145 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 REPS1Q96D71 796 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SNX6Q9UNH7 406 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TBL1XO60907 577 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 OTCP00480 354 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ALDH9A1P49189 494 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TAF10Q12962 218 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ACOX1Q15067 660 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TTC23Q5W5X9 447 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TWNKQ96RR1 684 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ACBD6Q9BR61 282 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KRT84Q9NSB2 600 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 DHRS12A0PJE2 317 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 E9PAM4 449 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 EPN2O95208 641 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 HSMCR30P0CW71 290 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RHOQP17081 205 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TTKP33981 857 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 DPP7Q9UHL4 492 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 CDH22Q9UJ99 828 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 OR4Q2P0C623 313 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 FBXW4P57775 412 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 IKBKEQ14164 716 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 USP41Q3LFD5 358 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TAC4Q86UU9 113 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LINGO1Q96FE5 620 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ABHD8Q96I13 439 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 H0YGN5 161 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 COX7A2P14406 83 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PPP2R1BP30154 601 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms