RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 XKR5Q6UX68 686 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 RRN3Q9NYV6 651 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NDUFA13Q9P0J0 144 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NRP2O60462 931 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP6V1B2P21281 511 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CHSY3Q70JA7 882 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ERO1BQ86YB8 467 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 AHI1Q8N157 1196 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 GPC2Q8N158 579 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT8Q8WV74 236 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 THAP11Q96EK4 314 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HAUS8Q9BT25 410 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 USP22Q9UPT9 525 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNC1P48547 511 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ESRRGP62508 458 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 KYAT1Q16773 422 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NCSTNQ92542 709 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HDAC10Q969S8 669 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM209Q96SK2 561 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 DOCK1Q14185 1865 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PIRO00625 290 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PGFP49763 221 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SCNN1GP51170 649 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXA1P55317 472 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP1A4Q13733 1029 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 LPIN1Q14693 890 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP51A1Q16850 503 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 UGP2Q16851 508 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PPTC7Q8NI37 304 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF181Q9P0P0 153 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 B4GAT1O43505 415 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 H6PDO95479 791 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC5A3P53794 718 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR141Q7Z602 305 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ASB9Q96DX5 294 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PHF24Q9UPV7 400 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC3P53804 2025 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PARP14Q460N5 1801 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A0J9YYE9 177 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP3P08254 477 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ARPP19P56211 112 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 RABL3Q5HYI8 236 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 MIB1Q86YT6 1006 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 OAZ3Q9UMX2 235 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 F8W810 466 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ARNTP27540 789 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 WNT3AP56704 352 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX17Q15036 470 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PAF1Q8N7H5 531 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM74Q96NL1 305 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGEB16A2A368 324 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 UBXN8O00124 270 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 TOMM70O94826 608 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF23P17027 643 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PAMP19021 973 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 OXTRP30559 389 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKCQQ04759 706 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 GRB7Q14451 532 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD11Q693B1 232 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms