RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPAMQ9HCL2 828 aa25.41■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM17Q9Y577 477 aa25.41■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 BACE2Q9Y5Z0 518 aa25.41■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL5AQ9Y689 179 aa25.41■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEMP1O14524 444 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMG1O95456 288 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINF2P08697 491 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 HK2P52789 917 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH4P55283 916 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 GALNT7Q86SF2 657 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 BBS5Q8N3I7 341 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 POMKQ9H5K3 350 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 LOC100653049A0A140TA62 436 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRID2O43424 1007 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 CIB2O75838 187 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT34O76011 436 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 S1PR4O95977 384 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC166P0CW27 439 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPRCAPQ14761 206 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGSF21Q96ID5 467 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUF2Q9BZD4 464 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC7A8Q9UHI5 535 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 VWA7Q9Y334 891 aa25.4■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 H3BNC9 293 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPOP01588 193 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIRTP0C851 137 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 GLDCP23378 1020 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPHA3P29320 983 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC6Q16204 474 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMNTD2Q8IXW0 634 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CWH43Q9H720 699 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 GKN1Q9NS71 199 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa25.39■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEMP2A6NFY4 417 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLKB1P03952 638 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAP2K2P36507 400 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SESN3P58005 492 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAA25Q14CX7 972 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPHS1O60500 1241 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SGSHP51688 502 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 OXCT1P55809 520 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACVR1Q04771 509 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLF10Q13118 480 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC14A2Q15849 920 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLC3Q6P597 504 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD49Q8WVL7 239 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF570Q96NI8 536 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGME1Q9BQP7 344 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 STOML1Q9UBI4 398 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEPT3Q9UH03 358 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CRYL1Q9Y2S2 319 aa25.38■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A088AWK7 358 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLCO1B7G3V0H7 640 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 STC2O76061 302 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 GLP2RO95838 553 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDKN2DP55273 166 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAJB13P59910 316 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 LAMB3Q13751 1172 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM67Q6ZTA4 783 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLD4Q96BZ4 506 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBXN10Q96LJ8 280 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 PANX3Q96QZ0 392 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 RETREG1Q9H6L5 497 aa25.37■■□□□ 1.65
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP4F11Q9HBI6 524 aa25.37■■□□□ 1.65
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