RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB15P59190 212 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YPEL5P62699 121 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAD51Q06609 339 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAMLD1Q13495 774 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PTK2BQ14289 1009 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CYTH1Q15438 398 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GUSBP11Q6P575 273 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MACC1Q6ZN28 852 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC7BQ86TV6 843 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VPS36Q86VN1 386 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBFAQ8N0V3 343 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IFI44Q8TCB0 444 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIC2Q96JB3 615 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EXOC2Q96KP1 924 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC61Q9BV99 259 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BOCQ9BWV1 1114 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRORYQ9H606 182 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYO6Q9UM54 1294 aa9.51□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LMO7DNF2Z398 122 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INSIG1O15503 277 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAMEF11O60813 436 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSO75390 466 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GCATO75600 419 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TM7SF2O76062 418 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PIGNO95427 931 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MPOP05164 745 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITIH2P19823 946 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TGM2P21980 687 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACTN2P35609 894 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDST2P52849 883 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THOP1P52888 689 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TPI1P60174 286 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TLE3Q04726 772 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELP6Q0PNE2 266 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GRM3Q14832 879 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IRF4Q15306 451 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDKN3Q16667 212 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UGP2Q16851 508 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AFMIDQ63HM1 303 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAPK15Q8TD08 544 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LMX1AQ8TE12 382 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL12RB2Q99665 862 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DONSONQ9NYP3 566 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPASTQ9UBP0 616 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.5□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 J3KR12 359 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TEX33O43247 280 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 USP12O75317 370 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MBD3O95983 291 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBXO45P0C2W1 286 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C6P13671 934 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DESP17661 470 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MMP12P39900 470 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RGRP47804 291 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LSSP48449 732 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PEX5P50542 639 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.49□□□□□ -0.89
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GABREP78334 506 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms