RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ALPPL2	P10696	532 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RGR	P47804	291 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	LSS	P48449	732 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS3	P57727	454 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TPM4	P67936	248 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ELP6	Q0PNE2	266 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	UGP2	Q16851	508 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCD	Q96DY2	449 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		17.89	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BM21	787 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		K7ESM1	405 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PALM	O75781	387 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPING1	P05155	500 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MPO	P05164	745 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF4	P15884	667 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	YPEL5	P62699	121 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED6	P86452	979 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	IL10RB	Q08334	325 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	AGER	Q15109	404 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	BOLA3	Q53S33	107 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS36	Q86VN1	386 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	LZTR1	Q8N653	840 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	APOLD1	Q96LR9	279 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP2	Q9H0W7	228 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZWILCH	Q9H900	591 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP4	O75096	1905 aa		17.88	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SPTA1	P02549	2419 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	USP12	O75317	370 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	NEBL	O76041	1014 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	GYPC	P04921	128 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	GP1BA	P07359	652 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	JUND	P17535	347 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRE	P78334	506 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PTK2B	Q14289	1009 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SRL	Q86TD4	932 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TBATA	Q96M53	351 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SP110	Q9HB58	689 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	USP29	Q9HBJ7	922 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087X0T9	212 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DFFA	O00273	331 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MUSK	O15146	869 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP9	O43315	295 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CS	O75390	466 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM228B	P0C875	321 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RARA	P10276	462 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	C6	P13671	934 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP12	P39900	470 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	IRF4	Q15306	451 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MACC1	Q6ZN28	852 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TEKT4	Q8WW24	435 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF599	Q96NL3	588 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PSKH2	Q96QS6	385 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DPH1	Q9BZG8	443 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	NENF	Q9UMX5	172 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		17.86	■□□□□ 0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		17.86	■□□□□ 0.45

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