RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 PRPHP41219 470 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 LINC00205P59089 165 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DRP2Q13474 957 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 EMC2Q15006 297 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SHHQ15465 462 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TCTN1Q2MV58 587 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 AWAT1Q58HT5 328 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CHPFQ8IZ52 775 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NEK9Q8TD19 979 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM143Q96AN5 459 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CEP170P1Q96L14 293 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 GDF15Q99988 308 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RAB34Q9BZG1 259 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 EBF3Q9H4W6 596 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 POLD4Q9HCU8 107 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 VWA8A3KMH1 1905 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CAPN8A6NHC0 703 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SPTLC2O15270 562 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MAGEB2O15479 319 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NBNO60934 754 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CHRNA1P02708 482 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 TMOD1P28289 359 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CD52P31358 61 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RFC2P35250 354 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 UBA7P41226 1012 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CFHR1Q03591 330 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 KRT79Q5XKE5 535 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 USP49Q70CQ1 688 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 TDHQ8IZJ6 230 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PDILTQ8N807 584 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NLRP4Q96MN2 994 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 PANK2Q9BZ23 570 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 COL4A6Q14031 1691 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 FAM227AF5H4B4 570 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 FRS3O43559 492 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CAND2O75155 1236 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RPS6KA5O75582 802 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RASAL1O95294 804 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 LYPLA2O95372 231 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MYBP10242 640 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RPA1P27694 616 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CCKBRP32239 447 aa4.74□□□□□ -1.65
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