RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FANCEQ9HB96 536 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CHRM3P20309 590 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 JAK1P23458 1154 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF132P52740 706 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TRNP1Q6NT89 227 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 EDEM1Q92611 657 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CERS2Q96G23 380 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 MRASO14807 208 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 POLBP06746 335 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 LRPAP1P30533 357 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 OCA2Q04671 838 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DHFR2Q86XF0 187 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 APPL2Q8NEU8 664 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SMOXQ9NWM0 555 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DSEQ9UL01 958 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 H3BNH8 94 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 EI24O14681 340 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CTBP1Q13363 440 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 RAB39AQ14964 217 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CHSY3Q70JA7 882 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 BNIPLQ7Z465 357 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DNAJB14Q8TBM8 379 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 OLAHQ9NV23 265 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 OR4Q2P0C623 313 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GOT1P17174 413 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GRM5P41594 1212 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZNX1 250 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DDIASQ8IXT1 998 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 B3GALT6Q96L58 329 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 MYO9BQ13459 2157 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 H3BMQ9 156 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 RNF103O00237 685 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ELK4P28324 431 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CTBSQ01459 385 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CYP51A1Q16850 503 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC14Q49A88 953 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PIGZQ86VD9 579 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 URGCPQ8TCY9 931 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GPR152Q8TDT2 470 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SNX27Q96L92 541 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 COG8Q96MW5 612 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 XPR1Q9UBH6 696 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FETUBQ9UGM5 382 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 XYLBO75191 536 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ATICP31939 592 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GP5P40197 560 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CDH13P55290 713 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ADAM17P78536 824 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TAP1Q03518 808 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ADIGQ0VDE8 80 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ADRM1Q16186 407 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GPR180Q86V85 440 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PLAC1Q9HBJ0 212 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 VDRP11473 427 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CCNA2P20248 432 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PRKCHP24723 683 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 YWHAQP27348 245 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ARL4AP40617 200 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CSHL1Q14406 222 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PIGGQ5H8A4 983 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 EPGNQ6UW88 154 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms