RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 FZD2Q14332 565 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 IRF4Q15306 451 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 GLRX5Q86SX6 157 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RFX6Q8HWS3 928 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 PLD5Q8N7P1 536 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 LGMNQ99538 433 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 SEMA3CQ99985 751 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 WASF3Q9UPY6 502 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RCCD1A6NED2 376 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 MATN3O15232 486 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 FFAR2O15552 330 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 MX2P20592 715 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RABIFP47224 123 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 PFN3P60673 137 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 RALGDSQ12967 914 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPRRQ15256 657 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC38Q5VT99 294 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 NPNTQ6UXI9 565 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 TEX26Q8N6G2 289 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 KLK13Q9UKR3 277 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 ALG6Q9Y672 507 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 APOL1O14791 398 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TNFSF14O43557 240 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 NEBLO76041 1014 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CPP00450 1065 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CCNB1P14635 433 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 FECHP22830 423 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DGKAP23743 735 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CCNCP24863 283 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DSC2Q02487 901 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC14Q15048 493 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC25A45Q8N413 288 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 MAML1Q92585 1016 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TSGA13Q96PP4 275 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR27Q9NS67 375 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNK1O00180 336 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 PCCBP05166 539 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 ELFN1P0C7U0 828 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 KRT10P13645 584 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 MARCKSL1P49006 195 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 THOP1P52888 689 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJC3Q13217 504 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DENND2CQ68D51 928 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DPPA4Q7L190 304 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 PARGQ86W56 976 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM174AQ8TBP5 190 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SMIM14Q96QK8 99 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP41Q9BYV8 373 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 KLF15Q9UIH9 416 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SPEGQ15772 3267 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A0U1RQS6 177 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM38O00635 465 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 SOCS5O75159 536 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 PIAS2O75928 621 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM16O95361 564 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms