RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 KCTD4Q8WVF5 259 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 GLRBP48167 497 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEHQ6S545 545 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RANBP10Q6VN20 620 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP93Q8N1F7 819 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf74Q96LT6 269 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 VWA8A3KMH1 1905 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 WASH4PA8MWX3 477 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ACOT8O14734 319 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 VILLO15195 856 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 EOMESO95936 686 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF460Q14592 562 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 UGP2Q16851 508 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TREX1Q9NSU2 369 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 GMIPQ9P107 970 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 DLX3O60479 287 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 JUNP05412 331 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 POLD2P49005 469 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ACLYP53396 1101 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP97Q8IW35 865 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR152Q8TDT2 470 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CNBD2Q96M20 576 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PKP2Q99959 881 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF186Q9NXI6 227 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ACOT9Q9Y305 439 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC1A2P43004 574 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf48Q96LL4 319 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 XPR1Q9UBH6 696 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MYBPC1Q00872 1141 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CREB5Q02930 508 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PCSK7Q16549 785 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 USP41Q3LFD5 358 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF148Q8N7C7 305 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM1BQ8NB78 822 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 HIC2Q96JB3 615 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MPP4Q96JB8 637 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPC5OSA6NMA1 111 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NPHS1O60500 1241 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTN5O94779 1100 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TBX4P57082 545 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NADK2Q4G0N4 442 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ALFQ53S48 1182 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 KDELC1Q6UW63 502 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 J3KR12 359 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TBX18O95935 607 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM58BPP0C7Q3 252 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31D3P0C874 917 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 WNT3AP56704 352 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB10P61026 200 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM189BP81408 668 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.02■■□□□ 1.44
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