RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 COPZ1P61923 177 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DGUOKQ16854 277 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 XYLT1Q86Y38 959 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LRCH4O75427 683 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TPSB2P20231 275 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 JAK1P23458 1154 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TPSAB1Q15661 275 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BSNDQ8WZ55 320 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZMPSTE24O75844 475 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.855e-7■□□□□ 11.3
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRBP14927 111 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN8P19075 237 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CDC25CP30307 473 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP11Q8TF27 550 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6AP2O75787 350 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C2P06681 752 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TAF10Q12962 218 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA7Q13683 1181 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT3Q14435 633 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BTRCQ9Y297 605 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPM1 405 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ASGR1P07306 291 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN19P0C672 248 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CCR4P51679 360 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CNSTQ6PJW8 725 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 COL26A1Q96A83 441 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LINGO1Q96FE5 620 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 IDO1P14902 403 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MC4RP32245 332 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ARL2P36404 184 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 XKR6Q5GH73 641 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TTC27Q6P3X3 843 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 OLFM1Q99784 485 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CTPS1P17812 591 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ICAM3P32942 547 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42P60953 191 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP4Q13115 394 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RHBGQ9H310 441 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DYTNA2CJ06 578 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf60A6NFR6 353 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FKTNO75072 461 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MPP4Q96JB8 637 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.852e-8■□□□□ 10.2
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 OR6A2O95222 327 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BPGMP07738 259 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ2P63252 427 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PACS2Q86VP3 889 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NOL4O94818 638 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA2P17301 1181 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AMD1P17707 334 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR3P22607 806 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GABRR2P28476 465 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF3Q13114 568 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM139Q8IV31 216 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms