RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAPC3Q92966 411 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1F2PQ96R84 312 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUZQ9BT04 418 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOTCH4Q99466 2003 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GUV1 79 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFITM10A6NMD0 228 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA12AO43301 675 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK8O60259 260 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZIC3O60481 467 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TACC1O75410 805 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE7O76087 117 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEXAP06865 529 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE12FP0CL80 117 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE12GP0CL81 117 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE12IP0CL82 117 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD58P19256 250 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPTP24298 496 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSTR2P30874 369 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFNA5P52803 228 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVFC1-1P60608 527 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT2Q10471 571 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIK3Q13003 919 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE1Q13065 139 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE4Q13068 117 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALCRLQ16602 461 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOXA1Q86UR1 476 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGBD5Q8N414 524 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF114Q8NC26 417 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL8Q96CD0 374 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX5Q96PT3 197 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAREM1Q9H706 876 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGA3Q9NZ52 723 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 MALT1Q9UDY8 824 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPED1A4D0V7 1026 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN4O14817 238 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDB3O75112 727 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETFAP13804 333 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGAXP20702 1163 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 UFM1P61960 85 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECT2LQ008S8 904 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMK1Q14012 370 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEDD9Q14511 834 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2R5BQ15173 497 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTN1Q2MV58 587 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCMH1Q96GD3 660 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOPT1Q96IL0 206 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL15Q96M94 604 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF570Q96NI8 536 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM4BO94953 1096 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF1P10914 325 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 XBP1P17861 261 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLG1Q12959 904 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFNB3Q15768 340 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms