RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCCD1A6NED2 376 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDC3O75056 442 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOCS5O75159 536 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6P13671 934 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNNT1P13805 278 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC25BP30305 580 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABIFP47224 123 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFN3P60673 137 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAF2Q12933 501 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALGPS1Q5JS13 557 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC11Q96DB2 347 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOR4AQ9NXH8 423 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MATN3O15232 486 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSTPIP1O43586 416 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MX2P20592 715 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNCP24863 283 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIG3P49916 1009 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZD2Q14332 565 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF4Q15306 451 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG1LQ6GMV1 187 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPPA4Q7L190 304 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM139Q8IV31 216 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAF1Q8N7H5 531 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SALL4Q9UJQ4 1053 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG6Q9Y672 507 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOL1O14791 398 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPP00450 1065 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK2P20155 84 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD7Q6UXD7 560 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO6A1Q86UG4 719 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA1Q8N8W4 532 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACRBPQ8NEB7 543 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT43Q96FT9 208 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA3CQ99985 751 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 FTSJ1Q9UET6 329 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPEGQ15772 3267 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP69A5D8W1 941 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF14O43557 240 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DKK1O94907 266 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM16O95361 564 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DQB2P05538 268 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN2BP42772 138 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARCKSL1P49006 195 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IHHQ14623 411 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGERQ15109 404 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAZQ16635 292 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 WSCD2Q2TBF2 565 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARGQ86W56 976 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFX6Q8HWS3 928 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC13Q8IYE1 715 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 EID2Q8N6I1 236 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 OLFM3Q96PB7 478 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGMNQ99538 433 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALT6Q9UBX8 382 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMACRQ9UHK6 382 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEY1Q9Y5J3 304 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP4O75096 1905 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQ67 120 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIAS2O75928 621 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGLSO95336 258 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNB1P14635 433 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 NME1P15531 152 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 GM2AP17900 193 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNLT1P63172 113 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSC2Q02487 901 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC14Q15048 493 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPNTQ6UXI9 565 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPIQ6XZB0 460 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A45Q8N413 288 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPC24Q8NBT2 197 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNYQ8ND76 341 aa19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms