RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 NCAM2O15394 837 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 BMP2P12643 396 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ARMCX2Q7L311 632 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 OFCC1Q8IZS5 231 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 SH3PXD2BA1X283 911 aa25.43■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 H3BRB1 525 aa25.43■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 PSMD7P51665 324 aa25.43■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.43■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ELP3Q9H9T3 547 aa25.43■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 MAP10Q9P2G4 905 aa25.43■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 DAOAP59103 153 aa25.42■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 UGP2Q16851 508 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ZBED5Q49AG3 693 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 FAM35AQ86V20 835 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 TNIP3Q96KP6 325 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ADI1Q9BV57 179 aa25.42■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 FAM45BPQ6NSW5 357 aa25.42■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 FAM45AQ8TCE6 357 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.42■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 SUPT3HO75486 399 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 MAPK10P53779 464 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 NAA20P61599 178 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 XKR5Q6UX68 686 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.662e-8■□□□□ 9.3
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SENP3-201ENST00000321337 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PPW3 197 aa25.41■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 VPS26BQ4G0F5 336 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 GPR107Q5VW38 600 aa25.41■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 SLC9A7Q96T83 725 aa25.41■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ARMC1Q9NVT9 282 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.41■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 NRCAMQ92823 1304 aa25.41■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 NUP107P57740 925 aa25.4■■□□□ 1.66
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SENP3-201ENST00000321337 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.4■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 CYGBQ8WWM9 190 aa25.4■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.4■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SENP3-201ENST00000321337 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.4■■□□□ 1.66
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