RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CLEC1BQ9P126 229 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GEMP55040 296 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TNK2Q07912 1038 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GRIN2CQ14957 1233 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TMED2Q15363 201 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GPR149Q86SP6 731 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 EBF3Q9H4W6 596 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 BFARQ9NZS9 450 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.44■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.43■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 CCDC77Q9BR77 488 aa16.43■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 A0A0U1RQS6 177 aa16.43■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 PHBP35232 272 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 KCNJ2P63252 427 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GALNT3Q14435 633 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PPM1NQ8N819 430 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ASB16Q96NS5 453 aa16.43■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 CLDND1Q9NY35 253 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.43■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ERVK-10P10266 1014 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 NMBRP28336 390 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 MESP2Q0VG99 397 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CDH17Q12864 832 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 44.6
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CHTF18-202ENST00000317063 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 EFHBQ8N7U6 833 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 IFT43Q96FT9 208 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SEPT3Q9UH03 358 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CHKBQ9Y259 395 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 INSIG1O15503 277 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TBX10O75333 385 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 IFNAR2P48551 515 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CCNG1P51959 295 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PSKH2Q96QS6 385 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PAFAH2Q99487 392 aa16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 C1QAP02745 245 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ADAM15Q13444 863 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SEPT6Q14141 434 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRE1Q14246 886 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 FATE1Q969F0 183 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CCL22O00626 93 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 FUT11Q495W5 492 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 MPP7Q5T2T1 576 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 MDM1Q8TC05 714 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC39Q96DD0 335 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 COL6A3P12111 3177 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PPM1 405 aa16.41■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.41■□□□□ 0.22
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