RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SMYD1Q8NB12 490 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HAT1O14929 419 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GSC2O15499 205 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEC1O60732 1142 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ECDO95905 644 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX4Q33E94 735 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC157Q569K6 752 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 COL26A1Q96A83 441 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD9Q9P000 198 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCR2P25025 360 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PFKPQ01813 784 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 INSCQ1MX18 579 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 AP3S1Q92572 193 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ING4Q9UNL4 249 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MEIS2O14770 477 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA5O15131 536 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 XKR6Q5GH73 641 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FAIM2Q9BWQ8 316 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL3P39023 403 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SCNN1GP51170 649 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 UTS2BQ765I0 119 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR180Q86V85 440 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PANX1Q96RD7 426 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA3CQ99985 751 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V0D1P61421 351 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 IQGAP1P46940 1657 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10H3O60404 316 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ERCC2P18074 760 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ACVR2BQ13705 512 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM13CQ8NE31 585 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR156Q8NFN8 814 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG3Q92685 438 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SSR3Q9UNL2 185 aa24.26■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A3O75751 556 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHX2P34913 555 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RHAGQ02094 409 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM47BQ8NA70 645 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 BORCS5Q969J3 196 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM138Q9NPI0 162 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3GLB1Q9Y371 365 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GK5Q6ZS86 529 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CMC1Q7Z7K0 106 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO10Q9UK96 956 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCL11O14625 94 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2ABP04908 130 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2F1P10589 423 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LGALS3BPQ08380 585 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H2ACQ93077 130 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52E6Q96RD3 313 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 TIPRLO75663 272 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CACUL1Q86Y37 369 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PSME2Q9UL46 239 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.25■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOX5P09917 674 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAR1AP10644 381 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL9P24844 172 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT3Q14435 633 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CUZD1Q86UP6 607 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD13Q9UNM6 376 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR1A1P14550 325 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK9P50750 372 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MED22Q15528 200 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF554Q86TJ5 538 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.24■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD10Q9BUL8 212 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms