RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 ITM2AO43736 263 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SLC1A2P43004 574 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ATG16L1Q676U5 607 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TNS4Q8IZW8 715 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ING5Q8WYH8 240 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SMIM14Q96QK8 99 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 RHOJQ9H4E5 214 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SZT2Q5T011 3432 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 AURKAO14965 403 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 DCTN3O75935 186 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TMCC1O94876 653 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PRAMEF12O95522 483 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SAT1P21673 171 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 AVPR1AP37288 418 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ARFIP2P53365 341 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 KCNJ2P63252 427 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CDK18Q07002 472 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SETDB1Q15047 1291 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CD248Q9HCU0 757 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 VPS51Q9UID3 782 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.5■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 K7ERQ8 282 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 RB1P06400 928 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SERPINF2P08697 491 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 STX3Q13277 289 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 IFT43Q96FT9 208 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 KITP10721 976 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CR2P20023 1033 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ARRB2P32121 409 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZNF460Q14592 562 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PTPRCAPQ14761 206 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 BBS5Q8N3I7 341 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 OR13J1Q8NGT2 312 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 COPG2Q9UBF2 871 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 HEY2Q9UBP5 337 aa21.49■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SIN3BO75182 1162 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 MPOP05164 745 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 T-ENOLP0DO92 83 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 MYL2P10916 166 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.48■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 HEATR9A2RTY3 570 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 INSIG1O15503 277 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CD70P32970 193 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ASRGL1Q7L266 308 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CPXM2Q8N436 756 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TRIB3Q96RU7 358 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 UNC5CO95185 931 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CBX6O95503 412 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PDHA1P08559 390 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SERPINB3P29508 390 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ARSDP51689 593 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 LMAN2Q12907 356 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 CEP97Q8IW35 865 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 FEM1CQ96JP0 617 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 RANBP9Q96S59 729 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 TASP1Q9H6P5 420 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.47■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 HAUS5O94927 633 aa21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 BMP1P13497 986 aa21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SOX17-201ENST00000297316 PTPRRQ15256 657 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms