RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 COLEC12Q5KU26 742 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KRT73Q86Y46 540 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CDT1Q9H211 546 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 WHRNQ9P202 907 aa11.93□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PIK3C2BO00750 1634 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6AP2O75787 350 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPN5P54829 565 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SSR2P43308 183 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 BNC1Q01954 994 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGEB18Q96M61 343 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGEB16A2A368 324 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CERS5Q8N5B7 392 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM110BQ8TC76 370 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATL1Q8WXF7 558 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 HDAC10Q969S8 669 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO19Q96H55 970 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0G2JN53 185 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM16LQ309B1 348 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PWWP2AQ96N64 755 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LDAHQ9H6V9 325 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MCUBQ9NWR8 336 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DMTF1Q9Y222 760 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GNSP15586 552 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 LRPAP1P30533 357 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 IFNGR2P38484 337 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DPYSL3Q14195 570 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX32Q86XE0 403 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS35Q96QK1 796 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.92□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MRASO14807 208 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM24O15164 1050 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5F1O95221 314 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP1A4Q13733 1029 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SGCBQ16585 318 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DHFR2Q86XF0 187 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF611Q8N823 705 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PRU2 124 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAPPC6AO75865 159 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.52e-8■□□□□ 8.9
UBASH3B-201ENST00000284273 LAG3P18627 525 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GALK1P51570 392 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FPGSQ05932 587 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDH1Q08174 1060 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 C3orf20Q8ND61 904 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NKD1Q969G9 470 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MIEF2Q96C03 454 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CHST7Q9NS84 486 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087X1B8 175 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10H3O60404 316 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GCATO75600 419 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PIGNO95427 931 aa11.91□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KDELR1P24390 212 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms