RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275036.11

HMGN3-201, Transcript of high mobility group nucleosomal binding domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-201ENST00000275036 TM7SF2O76062 418 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TPM1P09493 284 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CKMT2P17540 419 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CR2P20023 1033 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MMP12P39900 470 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SCNN1BP51168 640 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PFN3P60673 137 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TC2NQ8N9U0 490 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 OR4C6Q8NH72 309 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CCDC42Q96M95 316 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 U3KQA8 63 aa14.54□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MAP3K6O95382 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 C6P13671 934 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SERPINA4P29622 427 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MAN1A1P33908 653 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SERPINB6P35237 376 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 RABIFP47224 123 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 SUOXP51687 545 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MAXP61244 160 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 BCL2L1Q07817 233 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ELP6Q0PNE2 266 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 RALGDSQ12967 914 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF235Q14590 738 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MESDQ14696 234 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 CNGA4Q8IV77 575 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 PQLC3Q8N755 202 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 KCTD6Q8NC69 237 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 FAF2Q96CS3 445 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MGME1Q9BQP7 344 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TRIM5Q9C035 493 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.53□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HMGN3-201ENST00000275036 MTA2O94776 668 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 CSF2P04141 144 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 ACP1P24666 158 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 LIG3P49916 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RENBPP51606 427 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 AP1S1P61966 158 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 CYP4F3Q08477 520 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 PDK2Q15119 407 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 IRF4Q15306 451 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 CFAP58Q5T655 872 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 HES3Q5TGS1 186 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 PARGQ86W56 976 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RBFAQ8N0V3 343 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RAPGEF5Q92565 580 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 IFT43Q96FT9 208 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF670Q9BS34 389 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RBSNQ9H1K0 784 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 NOD2Q9HC29 1040 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RAXQ9Y2V3 346 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 K7ESM1 405 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 KRT7P08729 469 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 C1SP09871 688 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 GM2AP17900 193 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 KDELR1P24390 212 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 MMP13P45452 471 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 GBE1Q04446 702 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 GALNT2Q10471 571 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 TRAF2Q12933 501 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 IHHQ14623 411 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 ERAP2Q6P179 960 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 TEX26Q8N6G2 289 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 RFFLQ8WZ73 363 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 DKK4Q9UBT3 224 aa14.51□□□□□ -0.09
HMGN3-201ENST00000275036 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms