RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6CA6NDK9 693 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6BA6NDN3 693 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD3O43242 534 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 UGT2B4P06133 528 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6DP0CG33 693 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 OXTRP30559 389 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 DRG2P55039 364 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ11Q14654 390 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 USP30Q70CQ3 517 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FAM124AQ86V42 546 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf74Q86VG3 221 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 DPH5Q9H2P9 285 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 NUMA1Q14980 2115 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 E7EVH7 732 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 LILRB5O75023 590 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PMPCBO75439 489 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 AP2A1O95782 977 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TPSB2P20231 275 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CD6P30203 668 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 METAP1P53582 386 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 BCL2L1Q07817 233 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TRAF2Q12933 501 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TPSAB1Q15661 275 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 IZUMO3Q5VZ72 239 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 GDPD4Q6W3E5 623 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SLC36A4Q6YBV0 504 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PCGF5Q86SE9 256 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 AADATQ8N5Z0 425 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 MRGPRX2Q96LB1 330 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 HINFPQ9BQA5 517 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FAM86C1Q9NVL1 165 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 WHRNQ9P202 907 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K13O43283 966 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 HRO43593 1189 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SOCS5O75159 536 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFS2O75306 463 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PIGNO95427 931 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 APRTP07741 180 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINA4P29622 427 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 WNT3AP56704 352 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CFAP58Q5T655 872 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 THADAQ6YHU6 1953 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK1DQ8IU85 385 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PPIL6Q8IXY8 311 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA7Q8IZY2 2146 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PAF1Q8N7H5 531 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FRMD1Q8N878 549 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 NAT8LQ8N9F0 302 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 BBOF1Q8ND07 529 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 IPMKQ8NFU5 416 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ARRDC3Q96B67 414 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 BTBD1Q9H0C5 482 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 GRHL1Q9NZI5 618 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SERGEFQ9UGK8 458 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FZD4Q9ULV1 537 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 RAI2Q9Y5P3 530 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CEP192Q8TEP8 1941 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ESYT3A0FGR9 886 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PLK4O00444 970 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 NDC80O14777 642 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TP73O15350 636 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SUN1O94901 812 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV3-19P01714 112 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ITIH2P19823 946 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ITGB7P26010 798 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ADRA1AP35348 466 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 DRD3P35462 400 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 CNTN1Q12860 1018 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TRADDQ15628 312 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PCSK7Q16549 785 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF805Q5CZA5 627 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 SYCP2LQ5T4T6 812 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD22Q5VYY1 191 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 PRR23BQ6ZRT6 265 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 HOOK3Q86VS8 718 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 IFT81Q8WYA0 676 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 FEM1CQ96JP0 617 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 TRIB3Q96RU7 358 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD11-201ENST00000249504 NEUROG2Q9H2A3 272 aa19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.5 ms