RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029476.8

Sec22b-201, Transcript of Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sec22b, Length 2,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm10392Q3V3I3 114 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Snx25Q3ZT31 840 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hspa1aQ61696 641 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Samd4bQ80XS6 687 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Usp43Q8BUM9 1132 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vps26bQ8C0E2 336 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Itfg1Q99KW9 610 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sike1Q9CPR7 207 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cmtm6Q9CZ69 183 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Brca1P48754 1812 aa11.61□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PotegA5H0M4 473 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cylc2B1AWN8 422 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hsd17b7O88736 334 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Krt1P04104 637 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mtf2Q02395 593 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cpne9Q1RLL3 553 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 ArsiQ32KI9 573 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hexim2Q3TVI4 313 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam35aQ3UEN2 891 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Armc7Q3UJZ3 198 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Grm5Q3UVX5 1203 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ei24Q61070 340 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tnfaip2Q61333 691 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zdhhc17Q80TN5 632 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dnajb13Q80Y75 316 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zcchc4Q8BKW4 512 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Camk1dQ8BW96 385 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dclre1cQ8K4J0 705 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Stk32cQ8QZV4 488 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Smim11aQ99J19 55 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 DhddsQ99KU1 333 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ankrd61Q9CQM6 421 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CenpsQ9D084 142 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Adgrf4Q9D2L6 698 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Znf711A2ANX9 761 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zfp963D3Z2T8 383 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Daw1D3Z7A5 415 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1354E9Q5G9 310 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm13128L7MU96 475 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Atn1O35126 1175 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sult2b1O35400 338 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PdgfrbP05622 1098 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hoxd11P23813 323 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hmgcs2P54869 508 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cyp2a12P56593 492 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Polr2iP60898 125 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trpv5P69744 723 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ext2P70428 718 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Kctd21Q3URF8 260 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Taf1cQ6PDZ2 836 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zbtb24Q80X44 710 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fut11Q8BHC9 489 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Kank2Q8BX02 843 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Amer2Q8CCJ4 672 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Abhd11Q8K4F5 307 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gtse1Q8R080 741 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Impg1Q8R1W8 798 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lmcd1Q8VEE1 365 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cdhr5Q8VHF2 831 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Akap5D3YVF0 745 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm5930D3Z257 264 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 9330159F19RikD3Z623 648 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cyp2w1E9Q816 493 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm3043K7N693 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm16440K7N6G6 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm2244L7N2A3 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm3278L7N2D2 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm8271L7N2E2 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sh3pxd2aO89032 1124 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Myf6P15375 242 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PhexP70669 749 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Foxred2Q3USW5 665 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mfsd3Q5U419 412 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zbtb5Q7TQG0 670 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sytl5Q80T23 753 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lurap1lQ8K2P1 221 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r205Q8R276 316 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gfm2Q8R2Q4 779 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 IrgqQ8VIM9 583 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cacna1cQ01815 2139 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 ZxdbA2CE44 873 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 C7D3YXF5 845 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm281D3Z1Y0 860 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn2r74E9PW21 853 aa11.59□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Krt83E9Q1Y9 479 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms