RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641667.1

AP006294.2-201, humanhuman

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Gene AP006294.2, Length 209 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.34■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 EXOC5O00471 708 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 BCL9O00512 1426 aa28.32■■■□□ 2.12
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AP006294.2-201ENST00000641667 PEAK1Q9H792 1746 aa28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.3■■■□□ 2.12
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AP006294.2-201ENST00000641667 STK32BQ9NY57 414 aa28.27■■■□□ 2.12
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AP006294.2-201ENST00000641667 COL18A1P39060 1754 aa28.24■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 TXNRD1Q16881 649 aa28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 PROM2Q8N271 834 aa28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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AP006294.2-201ENST00000641667 AKAP12Q02952 1782 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ZBTB7AO95365 584 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC15A2Q16348 729 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ABCC6O95255 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
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AP006294.2-201ENST00000641667 MTFR1LQ9H019 292 aa28.16■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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AP006294.2-201ENST00000641667 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.14■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 CASZ1Q86V15 1759 aa28.14■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 PTGER2P43116 358 aa28.13■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 IL2RBP14784 551 aa28.12■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
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AP006294.2-201ENST00000641667 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD5Q99666 1765 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 USP31Q70CQ4 1352 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 NFAT5O94916 1531 aa28.1■■■□□ 2.09
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AP006294.2-201ENST00000641667 SYT17Q9BSW7 474 aa28.08■■■□□ 2.09
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AP006294.2-201ENST00000641667 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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AP006294.2-201ENST00000641667 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.01■■■□□ 2.07
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AP006294.2-201ENST00000641667 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.98■■■□□ 2.07
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AP006294.2-201ENST00000641667 AMPHP49418 695 aa27.86■■■□□ 2.05
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AP006294.2-201ENST00000641667 TONSLQ96HA7 1378 aa27.84■■■□□ 2.05
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AP006294.2-201ENST00000641667 KLHL34Q8N239 644 aa27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 HOXC9P31274 260 aa27.8■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.79■■■□□ 2.04
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