RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629485.2

PCBP1-AS1-347, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 784 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.363e-8■■■□□ 14.9
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 DDIT3P35638 169 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 GPS2Q13227 327 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 FMN1Q68DA7 1419 aa6.58□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ARID3CA6NKF2 412 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 APBB1O00213 710 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CYP2C19P33261 490 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 UVSSAQ2YD98 709 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 JMYQ8N9B5 988 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 KIF27Q86VH2 1401 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.57□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PLCG2P16885 1265 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ATP6V1AP38606 617 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NUCB2P80303 420 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ITFG2Q969R8 447 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 STK24Q9Y6E0 443 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.56□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PRXQ9BXM0 1461 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 KLHL33A6NCF5 533 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CTAGE5O15320 804 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 MBD3O95983 291 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ATP2B1P20020 1258 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 USP8P40818 1118 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TPM4P67936 248 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SEMA3FQ13275 785 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SETDB1Q15047 1291 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SMTNL1A8MU46 457 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ERCC3P19447 782 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 KIF18AQ8NI77 898 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CEP89Q96ST8 783 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 TRPC6Q9Y210 931 aa6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 PLXNC1O60486 1568 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 IVLP07476 585 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NLRP13Q86W25 1043 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SUFUQ9UMX1 484 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CUX1P39880 1505 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 SHROOM2Q13796 1616 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.53□□□□□ -1.36
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 E9PCH4 1651 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 MYO1CO00159 1063 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 MCTP2Q6DN12 878 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 IQUBQ8NA54 791 aa6.52□□□□□ -1.37
PCBP1-AS1-347ENST00000629485 RNF217Q8TC41 542 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms