RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLSCR1O15162 318 aa23.2■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTF1AQ7RTS3 328 aa23.2■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PIK3C2AO00443 1686 aa23.19■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.19■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LRRC37A3O60309 1634 aa23.18■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PEAK1Q9H792 1746 aa23.17■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.16■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y YY1P25490 414 aa23.16■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.15■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL18A1P39060 1754 aa23.15■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CARD10Q9BWT7 1032 aa23.15■■□□□ 1.3
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EXOC5O00471 708 aa23.14■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.14■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PROM2Q8N271 834 aa23.11■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SBF2Q86WG5 1849 aa23.1■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZBTB7AO95365 584 aa23.1■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NINLQ9Y2I6 1382 aa23.09■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TXNRD1Q16881 649 aa23.08■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STK32BQ9NY57 414 aa23.08■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.08■■□□□ 1.29
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WNK3Q9BYP7 1800 aa23.08■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AKAP12Q02952 1782 aa23.07■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RGPD5Q99666 1765 aa23.07■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC7Q96M83 1385 aa23.07■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMC1Q8TDI8 760 aa23.07■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BCL9O00512 1426 aa23.07■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NLRP2Q9NX02 1062 aa23.06■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFAT5O94916 1531 aa23.05■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NME9Q86XW9 330 aa23.05■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACSBG1Q96GR2 724 aa23.04■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC15A2Q16348 729 aa23.02■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CARD11Q9BXL7 1154 aa23.02■■□□□ 1.28
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TNS2Q63HR2 1409 aa23■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CASZ1Q86V15 1759 aa23■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ERBB3P21860 1342 aa23■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP31Q70CQ4 1352 aa23■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IL2RBP14784 551 aa22.99■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTGER2P43116 358 aa22.99■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.99■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.98■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABCC6O95255 1503 aa22.98■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MON2Q7Z3U7 1717 aa22.97■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.97■■□□□ 1.27
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MTFR1LQ9H019 292 aa22.95■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CD163L1Q9NR16 1453 aa22.95■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.95■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYOM1P52179 1685 aa22.93■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SYT17Q9BSW7 474 aa22.92■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NHSQ6T4R5 1651 aa22.91■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LTN1O94822 1766 aa22.9■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y A0A1W2PP64 1363 aa22.89■■□□□ 1.26
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TONSLQ96HA7 1378 aa22.89■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP54Q70EL1 1684 aa22.87■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IP6K1Q92551 441 aa22.87■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARXQ96QS3 562 aa22.87■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SGIP1Q9BQI5 828 aa22.87■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF827Q17R98 1081 aa22.86■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LRRC4BQ9NT99 713 aa22.86■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COG3Q96JB2 828 aa22.84■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BTAF1O14981 1849 aa22.84■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AMPHP49418 695 aa22.82■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLHL34Q8N239 644 aa22.82■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FBLN1P23142 703 aa22.81■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PAPPAQ13219 1627 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KCNQ4P56696 695 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.8■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HOXC9P31274 260 aa22.79■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AKT1S1Q96B36 256 aa22.79■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.79■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLD1P28340 1107 aa22.77■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPR162Q16538 588 aa22.77■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TESK2Q96S53 571 aa22.77■■□□□ 1.24
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC16A10Q8TF71 515 aa22.75■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.75■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.74■■□□□ 1.23
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