RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SOX12O15370 315 aa34.63■■■■□ 3.13
PMS1-220ENST00000618056 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
PMS1-220ENST00000618056 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.59■■■■□ 3.13
PMS1-220ENST00000618056 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-220ENST00000618056 COG3Q96JB2 828 aa34.56■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 CRB1P82279 1406 aa34.56■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 BARGINQ6ZT62 677 aa34.55■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 A0A0G2JS52 829 aa34.54■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 MYT1Q01538 1121 aa34.54■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.54■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 FYB1O15117 783 aa34.53■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.52■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.52■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 USP35Q9P2H5 1018 aa34.52■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.52■■■■□ 3.12
PMS1-220ENST00000618056 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.49■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.48■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.47■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.46■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.46■■■■□ 3.11
PMS1-220ENST00000618056 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 CCDC125Q86Z20 511 aa34.45■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.41■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 ERBB3P21860 1342 aa34.41■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.4■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 IP6K1Q92551 441 aa34.39■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.39■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.39■■■■□ 3.1
PMS1-220ENST00000618056 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.37■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 CCDC7Q96M83 1385 aa34.35■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 FBLN1P23142 703 aa34.35■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 RTL1A6NKG5 1358 aa34.35■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 LRRC37A3O60309 1634 aa34.35■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.34■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.34■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 PANK3Q9H999 370 aa34.34■■■■□ 3.09
PMS1-220ENST00000618056 HOXC9P31274 260 aa34.32■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 PDE3BQ13370 1112 aa34.32■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 DISP2A7MBM2 1401 aa34.32■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.31■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 AMPHP49418 695 aa34.31■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 FAM182BQ5T319 152 aa34.31■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.28■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.28■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.28■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 PEAK1Q9H792 1746 aa34.27■■■■□ 3.08
PMS1-220ENST00000618056 DDB1Q16531 1140 aa34.26■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.25■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 NSD2O96028 1365 aa34.23■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 FLT4P35916 1363 aa34.23■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
PMS1-220ENST00000618056 INSRP06213 1382 aa34.19■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 SBF2Q86WG5 1849 aa34.19■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.19■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 TNS2Q63HR2 1409 aa34.18■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 EXOC5O00471 708 aa34.16■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 IL2RBP14784 551 aa34.16■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.16■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.16■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.15■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.15■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.15■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 BCL9O00512 1426 aa34.14■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 BAG6P46379 1132 aa34.14■■■■□ 3.06
PMS1-220ENST00000618056 TRIM37O94972 964 aa34.13■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 POLKQ9UBT6 870 aa34.11■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.07■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 NBPF4Q96M43 638 aa34.07■■■■□ 3.05
PMS1-220ENST00000618056 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 MORC1Q86VD1 984 aa34.04■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.03■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 MEGF6O75095 1541 aa34.02■■■■□ 3.04
PMS1-220ENST00000618056 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.01■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 APBA3O96018 575 aa34.01■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 NCAPD2Q15021 1401 aa34■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.99■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.99■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.98■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.98■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.97■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 NHSQ6T4R5 1651 aa33.96■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 RREB1Q92766 1687 aa33.96■■■■□ 3.03
PMS1-220ENST00000618056 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms