RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 A0A1W2PP64 1363 aa16.27■□□□□ 0.2
DDB2-208ENST00000614825 USP47Q96K76 1375 aa16.27■□□□□ 0.2
DDB2-208ENST00000614825 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.27■□□□□ 0.2
DDB2-208ENST00000614825 APBA3O96018 575 aa16.27■□□□□ 0.2
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DDB2-208ENST00000614825 TMF1P82094 1093 aa16.26■□□□□ 0.19
DDB2-208ENST00000614825 DDB1Q16531 1140 aa16.26■□□□□ 0.19
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DDB2-208ENST00000614825 COL18A1P39060 1754 aa16.24■□□□□ 0.19
DDB2-208ENST00000614825 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
DDB2-208ENST00000614825 USP31Q70CQ4 1352 aa16.24■□□□□ 0.19
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DDB2-208ENST00000614825 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.22■□□□□ 0.19
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DDB2-208ENST00000614825 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.2■□□□□ 0.18
DDB2-208ENST00000614825 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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DDB2-208ENST00000614825 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.19■□□□□ 0.18
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DDB2-208ENST00000614825 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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DDB2-208ENST00000614825 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.14■□□□□ 0.17
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DDB2-208ENST00000614825 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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DDB2-208ENST00000614825 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.06■□□□□ 0.16
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DDB2-208ENST00000614825 NBPF4Q96M43 638 aa16.02■□□□□ 0.16
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DDB2-208ENST00000614825 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.02■□□□□ 0.16
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DDB2-208ENST00000614825 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.01■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 FLT4P35916 1363 aa16■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 RGPD2P0DJD1 1756 aa16■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 STK32BQ9NY57 414 aa16■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
DDB2-208ENST00000614825 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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