RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PDCP20941 246 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 PRXQ9BXM0 1461 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 MCM2P49736 904 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 107
CTDP1-208ENST00000613122 FCHSD2O94868 740 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.08■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC69A6NI79 296 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 AACSQ86V21 672 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF11O15085 1522 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 TIAM1Q13009 1591 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 SRGAP3O43295 1099 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 BCAR3O75815 825 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 PDILTQ8N807 584 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 RAI14Q9P0K7 980 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 KINO60870 393 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 RABEP1Q15276 862 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 SOGA3Q5TF21 947 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 NFE2L2Q16236 605 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 STK38Q15208 465 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 IQGAP2Q13576 1575 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD1Q15327 319 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRL1O94910 1474 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 ZPR1O75312 459 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-208ENST00000613122 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.01■■□□□ 1.43
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CTDP1-208ENST00000613122 TDO2P48775 406 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 TMOD2Q9NZR1 351 aa24■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 IFT57Q9NWB7 429 aa24■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 JMYQ8N9B5 988 aa24■■□□□ 1.43
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CTDP1-208ENST00000613122 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.99■■□□□ 1.43
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CTDP1-208ENST00000613122 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 RUFY1Q96T51 708 aa23.97■■□□□ 1.43
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CTDP1-208ENST00000613122 MNS1Q8NEH6 495 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDP1-208ENST00000613122 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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CTDP1-208ENST00000613122 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
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CTDP1-208ENST00000613122 CDR1P51861 262 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 NGLY1Q96IV0 654 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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CTDP1-208ENST00000613122 KIF14Q15058 1648 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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CTDP1-208ENST00000613122 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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CTDP1-208ENST00000613122 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 SMARCE1Q969G3 411 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 MCM10Q7L590 875 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 SMC2O95347 1197 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 FIBPO43427 364 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.92■■□□□ 1.42
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