RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP6P59044 892 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC15A2Q16348 729 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TXNRD1Q16881 649 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTFR1LQ9H019 292 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SBF2Q86WG5 1849 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCL9O00512 1426 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UTRNP46939 3433 aa22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EXOC5O00471 708 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARXQ96QS3 562 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CABP2Q9NPB3 220 aa22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AKAP12Q02952 1782 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLIT3O75094 1523 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFFO2Q5TF58 517 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPR162Q16538 588 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP6P35125 1406 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHD4Q14839 1912 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CABP1Q9NZU7 370 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOX12O15370 315 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLHL34Q8N239 644 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAP3K5Q99683 1374 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC7Q96M83 1385 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL18A1P39060 1754 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNS2Q63HR2 1409 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIK3C2AO00443 1686 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLD1P28340 1107 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NHSQ6T4R5 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF827Q17R98 1081 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EVC2Q86UK5 1308 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGPD5Q99666 1765 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAPPAQ13219 1627 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IL2RBP14784 551 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC6O95255 1503 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFAT5O94916 1531 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERBB3P21860 1342 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRIN3BO60391 1043 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AKT1S1Q96B36 256 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BTAF1O14981 1849 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MSH5O43196 834 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP350Q5VT06 3117 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNQ4P56696 695 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP10DQ9P241 1426 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP31Q70CQ4 1352 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NME9Q86XW9 330 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSPA6P17066 643 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LTN1O94822 1766 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MSL1Q68DK7 614 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.8 ms